Expression profiling:
Neue Möglichkeiten zur Identifizierung krankheitsrelevanter Gene
Dr. Jan Schäferkordt, Memorec Stoffel GmbH, Stöckheimer Weg 1, 50829 Köln
Mit der Entschlüsselung des humanen Genoms erhielt man ein tieferes Verständnis in die molekularen Zusammenhänge des Menschen und die Pathogenese von Krankheiten. Zugleich mußte jedoch auch festgestellt werden, daß die meisten Krankheiten durch das fehlerhafte Zusammenspiel vieler Gene zustande kommt. Um die Expression von Genen beschreiben zu können, werden in der Molekularbiologie Northern Blot Analyse, real time PCR, SAGETM und Microarrays eingesetzt. Letztere Methode stellt vom Prinzip her einen hoch parallelen Northern Blot dar, der derzeit auf Grund vielseitiger Anwendungsmöglichkeiten zunehmend an Bedeutung gewinnt. Im Vordergrund stehen molekularmedizinischen Fragestellungen wie die Diagnose und prognostische Einschätzung von Krankheiten aber auch die Analyse von Gen-Interaktionen sowie die Funktionsanalyse von Genen. Durch die Verwendung von bioinformatisch vorvalidierten cDNA-Fragmenten, hohen Qualitätsstandarts bei der Produktion und der Automation von Arbeitsprozessen können zuverlässige Informationen über die Expressionsstärke definierter Gene gewonnen werden.
Der Vortrag gibt einen kurzen Überblick über die Technologie der Microarrays und stellt anhand von Beispielen die Aussagefähigkeit von Expressions-Profilen dar. Die Chip-Technologie ist eine leistungsfähige Methode, die bei der Analyse von SPG-Mausmodellen zum tieferen Verständnis der FSP Pathogenese beitragen kann.