Professor Ernst Ludwig Winnacker gehört zu den wichtigsten Forschungsförderern Europas. Der Biochemiker stand von 1998 bis Ende 2006 an der Spitze der Deutschen Forschungsgemeinschaft (DFG). Von 2007 bis Mitte 2009 war Winnacker erster Generalsekretär des Europäischen Forschungsrates(ERC), der von Brüssel aus die Realisierung des "Forschungsraums Europa" vorantreiben soll. Zur Zeit ist Winnacker in Straßburg als Generalsekretär der International Human Frontier Science Program Organization (HFSPO) tätig. Die 1989 gegründete HFSPO fördert die internationale Forschung im Bereich der Lebenswissenschaften und will dabei vor allem die Förderung junger Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler verbessern.
Prof.Winnacker ist bereits seit 2008 SchrittMacher der Tom Wahlig Stiftung.